Genome Research | 湖南大學(xué)羅宵教授課題組：基于泛基因組圖的菌株水平宏基因組分類(lèi)及定量工具
宏基因組分類(lèi)分析旨在通過(guò)分析全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)來(lái)識(shí)別和量化樣本中存在的微生物。已有大量先進(jìn)工具用于物種水平的注釋?zhuān)欢晃锓N內(nèi)的不同菌株存在遺傳變異，這些菌株可能表現(xiàn)出不同的表型和功能。因此在菌株水平上識(shí)別和量化微生物是必要的。在菌株水平上進(jìn)行分類(lèi)是非常具有挑戰(zhàn)性的，盡管有些工具已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了菌株水平分類(lèi)，但仍存在諸多局限性，包括分類(lèi)準(zhǔn)確率，更復(fù)雜的多物種數(shù)據(jù)集分類(lèi)，僅支持short read或long read數(shù)據(jù)...
